Podczas jego pontyfikatu narodził się spór o ważność chrztu apostatów i heretyków. Niektórzy biskupi Afryki Północnej oraz Azji Mniejszej uważali, że pragnący powrócić po wyparciu się wiary do wspólnoty Kościoła muszą przyjąć powtórniechrzest. Stefan I był temu zdecydowanie przeciwny, co niemal doprowadziło do zerwania jedności z tymi Kościołami.

W tym samym czasie antypapieżem był Nowacjan.

Jest czczony 1 sierpnia.